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性状差异
山豆根：为豆科植物越南槐的干燥根及根茎，主产于广东、广西，又习称为“广豆根”。其根茎呈不规则结节状，根茎长圆柱形，略弯曲，常有分支，长短不等。表面灰棕色至棕褐色，有纵皱纹及横长皮孔样突起，质坚硬不易折断。饮片性状为类圆形薄片，表面皮部浅棕色，木部淡黄色，周边棕色或棕褐色，质坚硬，有豆腥气，味极苦。
北豆根：为防己科植物蝙蝠葛的干燥根茎。主产于东北、河北、山东、山西等地。其根茎呈细长圆柱形，表面黄棕色至暗棕色，多有弯曲的细根，并可见突起的根痕及纵皱纹。外皮易剥落，质韧不易折断。饮片性状为类圆形厚片，切面灰白至淡黄色，木部淡黄色，呈放射状排列，中心有髓，周边棕黄色至淡棕色，气微味苦。
功效差异
山豆根：具有清热解毒、消肿利咽之功效。主治热毒炽盛、火毒蕴结之咽肿、喉痛、喉风、牙龈肿痛等。
北豆根：具有清热解毒、祛风止痛的之功效。主治咽喉肿痛、扁桃体炎、风湿痛、四肢麻木、肠炎痢疾等。
毒性差异
山豆根：现代研究表明，山豆根所含之苦参碱能作用于大脑，引起痉挛， 能麻痹横隔膜和呼吸肌运动神经末梢。以山豆根25g/kg 煎液小鼠灌肠， 结果出现呼吸抑制和震颠、痉挛、死亡。
北豆根：北豆根主要成分为蝙蝠葛碱，研究发现，以蝙蝠葛碱所作的亚急性毒性实验表明，该药4.8～60毫克 剂量用药18天或2～3月，对心脏无不良影响，150毫克以上剂量用药 2～3个月对肝脏有不同程度的损害， 受损程度随剂量增大而加重， 所致的是轻度损害， 150毫克以下对肾和肾上腺基本无不良影响。
因此，虽然二者都具有清热解毒的作用， 但山豆根含有的主要成分苦参碱，毒性大于北豆根含有的蝙蝠葛碱。2010版《中国药典》中北豆根用量为3~9克，而山豆根用量为3~6克，其目的就是要防止中毒事故的发生。因此无论是经营销售部门还是各医疗单位，均应以药典为准， 将二药分别使用， 切不可相互混用。
