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藏象辨证体系是在中医藏象理论指导下，遵循“以象测藏、从症辨证”的原则，分析临床信息，识别疾病当前阶段藏系统的病位与病性，概括为完整、规范证名的诊断思维过程。吴承玉提出“以藏系统为病位核心，按病性分类立证”的证体系，将中医辨证与五脏系统生理病理紧密结合，为临床诊疗提供了新的认知模式。
构成证(简称Z)诊断的核心为藏象辨证要素(简称Xn)，来源于临床信息，主要从四个方面获取：一是对该证诊断具有特殊意义的最常见症状以及特异性症状，能明确提示藏象病位与藏象病性，在诊断上具有特定意义，为主症(简称A);二是一般伴随症状，在该证中出现频率较高，在诊断上具有完善性和辅助性意义，可帮助确立藏象病位与藏象病性，或不同程度地顾及该证的变异型、非典型型、过渡型的诊断，为次症(简称B);三是舌脉变化(简称C);四是西医学检验指标(简称D)。
藏象辨证要素的辨识包含12条组合规律：⑴A+B+C+D→Xn→Z;⑵A+B+C→Xn→Z;⑶A+B+D→Xn→Z;⑷A+C+D→Xn→Z;⑸B+C+D→Xn→Z;⑹A+B→Xn→Z;⑺A+C→Xn→Z;⑻A+D→Xn→Z;⑼B+C→Xn→Z;⑽B+D→Xn→Z;⑾C+D→Xn→Z;⑿A1+A2+……+An→Xn→Z(An代表多个并存的主症)。由此确立了由临床信息辨识藏象病位、藏象病性，再由藏象病位、藏象病性组合成证的藏象辨证思维模式。
藏象辨证体系突出了“原则性和灵活性相结合”“病证结合”的辨证原则，不仅奠定了辨证规范化的基础，使中医临床辨证有规律可循，而且体现圆机活法，因人制宜，符合个体化诊疗模式的特点。同时将中医学“辨证”与西医学“辨病”相结合，实现临床既针对现阶段的即时性，又把握全病程的预见性，是中西医学兼容互补的一个范例。藏象辨证理论还潜藏建立智能辨证软件的应用前景，可为未来中医智能诊疗系统的开发提供理论基础。
